美作の国（岡山県）讃甘郡宮本村に生まれた武蔵（たけぞう）は、継母にいじめられる日々を過ごしていた。力が強いのをいいことに、村では乱暴ばかりをはたらき迷惑ばかりかけていた。ある時、近所の寺の宗禅和尚に捕えられ懲らしめられる。「おのれの強さはけだものの強さだ、人間の強さではない」と和尚にいわれた武蔵は、本当の強さとは何かを求めて旅に出た。宮本武蔵の波乱の生涯を、石ノ森章太郎があざやかに描き出す!!

武蔵は旅をしながら様々な武芸者と仕合ううちに、兵法者として天下にその名を知らしめた。またその頃、同じように天下に名を知らした天才剣士・佐々木小次郎があった。お互いの噂を聞いた二人は引き寄せられるように、九州・小倉の地に入る。小倉の町はどちらが天下一かで沸き立ち、小次郎を兵法指南役として抱える細川家の計らいで、二人はとうとう仕合うことになる。宮本武蔵の波乱の生涯を、石ノ森章太郎があざやかに描き出す！