【デジタル版限定！巻末に描き下ろし特典イラスト付き！】人類の存続をかけて今、姉弟ふたりに希望は委ねられた…　未知の侵略者・イドラに脅かされるニューヨーク。事故で両足の自由を失い、姉アンナと共に生活する少年イリヤは、唯一対抗出来る対イドラ生体兵器「アルカナ」の操縦者に志願する。だがそれは、ふたりの過酷な戦いの始まりだった…。

イドラとの闘いで仲間を失ったイリヤ。その時、戦争と死がリアルになる……。　単騎出撃した先輩チームのラルフが命を落とす…。相方である兄を失ったメンデルを目の当たりにし、ショックを受けつつもイドラ落下の阻止に向かうイリヤ。イリヤは仲間の死の先に、何かを掴むことが出来るのか!!?

墜落したアンナの身体に起こる異変…。姉弟は、ヒトと怪物の境界線に向き合う――。ついにCIO本部に人型イドラが到達してしまう!!　混乱の中、イドラに対面した科学者のジェフの真意は!?　そして黒い繭の中から救出されたアンナは隔離されることに。イドラとアルカナの秘密に翻弄されるイリヤとアンナの運命は!!