チューニングショップ・RGOをやめた荻島信二（おぎしま・しんじ）は、かつて編集していたチューニング雑誌「GTカーズ」をウェブ上で展開するなど、若手自動車ライターとして活躍しつつあった。そんな中、ニセRGOステッカーを貼ったFD型RX-7が首都高に現れたり、「GTカーズ」の権利を買ったという男・荒井（あらい）が現れたりと、荻島の周辺が動き始める……！　『湾岸ミッドナイト』のセカンドステージ!!!

自動車評論家の荒井（あらい）が主導するチューニング雑誌「GTカーズ」復活の動きに、荻島（おぎしま）、ノブ、リカコら、様々な人間が関わるようになっていく。そんな中、荻島は、新「GTカーズ」のスポンサーである椎名耕平（しいな・こうへい）から、荒井の過去を聞かされることになる。なんと荒井は、荻島が夢中になって読んだ企画「C1アタックFD号」を手掛けた顔出しNGの編集者・RYOであった……！

ノブに続いてエリも、新「GTカーズ」編集部でバイトするようになる中、荻島（おぎしま）は、内定していたカーオブイヤー審査員をおりる決断を下す。そして、「GTカーズ」復活の旗振り役である荒井（あらい）の次の狙いは、「マッドドッグ」と呼ばれた32GT-R乗りの佐藤（さとう）に向かう――。

90年代の伝説の首都高ランナー・佐藤（さとう）の32Rを駆る機会を得たノブは、RX-7とGT-Rの差に戸惑いつつも、徐々に順応していく。それを見たリカコは、C1外回りのタイムアタックの許可を佐藤から取るが、かつて「マッドドッグ」と呼ばれた佐藤の中で、何かが燻り始めて――。

自動車評論家の荒井（あらい）が主導するチューニング雑誌「GTカーズ」復活の動きに、かつて「マッドドッグ」と呼ばれた32GT-R乗りの佐藤（さとう）も巻き込まれていく。そして、かつて佐藤のRを整備した渋川（しぶかわ）という男の存在が浮上。渋川は、口ではノブやRX-7をけなしつつも、面倒をみたいと申し出る。そんな中、佐藤はノブとの走りに向け、RGOのリカコと組むことを決める。その走りを最後に、走り屋という形から降りることを決意しつつ――。

ノブとマッドドッグ佐藤（さとう）とのC1アタックの日が決まり、荒井（あらい）、木村（きむら）や荻島（おぎしま）は、そのための段取りを着々と進めていく。そんな中、荒井はノブを連れて、故郷の愛媛へ出張することに。荒井が言う「ノブに見せたいモノ」とは――!?

ノブとマッドドッグ佐藤（さとう）のC1アタック目前。ノブは、自らのFDにドッグミッションを載せ、その日に備える。そんな中、アジア系のICT企業が、「GTカーズ」の買収を希望してると聞いた荒井（あらい）は、ある重大な決断を下すが……!?

マッドドッグ佐藤（さとう）とノブとのC1アタックから2週間が経った。その間、チューニング誌「GTカーズ」はデジタル雑誌として再スタートを切り、ノブの走りは、より丁寧に、そして深く、変貌を遂げていた。そんな中、病院で見かけた黒いポルシェの圧倒的オーラ感にヤラれたノブは、そのオーナー・島（しま）との邂逅を果たすが――。

自動車チューニング誌「GTカーズ」は、デジタル雑誌として再スタートし、ベスト版の形で、紙の雑誌としても復活した。そんな中、ノブは、走りの管理を託された伝説のポルシェターボ・ブラックバード号で走り込み、荒井（あらい）は幕張メッセで開催されるカスタムショーに連日通っていた。荒井の目当ては、有栖（ありす）ガレージの35GT-R。ワケありのチューナー・有栖は、荒井への手紙と共に、その35RをRGOに託すのだが……！

「GTカーズ」に接近してきた有栖（ありす）ガレージ代表・タカの目的は、かつて製作したコンプリートGT-R（アライズR）を捜し出し、ブラックバード号を撃墜することにあった。そしてタカはついに、自身が完成形と認めたアライズ34R7号車が、ワケありの状態で岡山にあることを知る……！