ダンジョンが現れて5年。そこは15歳以上の人間の自由意志のみで入場が許可される不思議空間。学校生活に馴染めない六条祐太は、15歳の誕生日に1人ダンジョンに挑むことにしたが…!?

順調にレベル上げを進める祐太と美鈴。２人のパーティーにアメリカのトップモデルであるエヴィー・ノヴァ・ティンバーレイクが合流することになる。レベル1000を目指す３人は、甲府ダンジョンから池袋にある特級ダンジョンに再度挑もうとするが…!?

無理だと思われていたダンジョン攻略を順調に進め、二階層への階段を見つけた祐太。祐太がレベル上げに成功し、学校の高嶺の花である美鈴とパーティを組んでいることが気に入らない池本と小春は!?