正義感の強い青年、神来社 颯（からいと そう）は、普段はごく普通の大学生。 しかしその裏では“クリミナルハンター”として、神にも悪魔にもなれるアプリを搭載したスマホを手に、世に蔓延る悪を狩る――。 怒りと正義が交差する壮絶な復讐劇、開幕！

正義感の強い青年、神来社 颯（からいと そう）は、普段はごく普通の大学生。 裕福な家庭で育ち、このまま順風満帆な人生を歩むはずだった。 しかし、突如謎の集団が家族を襲撃。目の前で父親が射殺され、さらには自らも胸を撃たれ瀕死の重傷を負う。奇跡的に一命を取り留めた神来社の目の前に現れたのは、床加野（どこかの）警察署警視にして裏の顔を持つ監視者（ウォッチメン）・城建 琴美（しろたて ことみ）。 彼女は神来社に“神スマホ”を渡し、犯罪者を狩るクリミナルハンターに任命する。 最初の標的はカボチャ仮面という賞金首だったが、相手も神スマホの所有者だった。予測不能な攻撃に神来社は早くも追い詰められる。 絶望の淵で、彼はどんな一手を放つのか――。

「カボチャ仮面」との死闘で満身創痍の神来社 颯（からいと そう）は、ゴッド・ツールズの技術を結集した半サイボーグ手術を受ける。 新たな相棒のアシスタントA・I モカと協力し、賞金1,200,000円の犯罪者「ハガネ仮面」に立ち向かう!! 今までよりさらに凶悪かつ強力な敵に、神来社の知略が炸裂する!?

苦戦を強いられるも、モカのサポートを受けながらハガネ仮面に勝利した神来社(からいと)。その場を立ち去ろうとした瞬間、突如として謎の女性二人組が現れる。「間瀬沼 保(マセヌマ タモツ)は殺したから」そう冷たく言い放つ彼女たちの正体とは!? これまで見たことのない新たな脅威(アプリ)が神来社を容赦なく襲う…!!