いつもの通学路で警官に呼び止められ、遅刻した筒野悟希。遅れて入った教室には、自らをA先生と名乗る謎の女性と、透明な容器に入れられた大量の脳が並ぶ異様な光景が!?　閉じ込められた教室でクラスメイトを元に戻すため、世界を救うため、過酷な授業が始まる!!

他の教室に監禁されていた広森明音を救い出した筒野悟希は、体育館で次の授業に臨む。広森の思念交信（テレパシー）と筒野の念動力（テレキネシス）を使い、スイカを割ることが出来るのか？　一方、地球の所有権を主張する8つの存在対地球の存亡をかけた戦いが始まる。そして筒野達へも、ことの真相が!?