全世界待望！　新生「攻殻機動隊」！　――高級料亭でロボット芸者が外務大臣たちを拘束する事件が発生した。指揮権を掌握した超法規部隊・公安9課は瞬時に人質を救出するが、事件の裏には犯人の恐るべき陰謀が隠されていた!!　狡猾な犯人と精鋭集団・公安9課の戦いを描いたサスペンスアクションの1stシリーズ。「外務大臣拘束事件」編を完全収録!!

死亡した設計者の搭乗する新型戦車が、両親への復讐のために暴走を始めた。戦車開発会社の剣菱重工は、公安9課の力だけで戦車の暴走を止めるよう依頼するが、ハイテク戦車には9課の攻撃がまったく通用しない。そこで少佐は捨て身とも思えるような大胆な作戦に出る。果たして少佐は、最強の暴走戦車を食い止め、両親への復讐を防ぐことが出来るのか!?

南米の英雄といわれる革命戦士、マルセロ・ジャーティ。麻薬王という裏の顔を持つ男が、秘密裏に来日していることが発覚した。公安9課はマルセロが密かに来日を繰り返す理由を暴くよう政府から指示を受ける。早速、公安9課は尾行を開始し、マルセロが滞在するホテルを突き止めた。公安9課が監視を続けていると、電脳麻薬の元締めの暴力団幹部・権藤（ごんどう）がホテルに現れた。マルセロ来日の目的とは麻薬の取引!?　衝撃の結末が訪れる！　大反響の「偶像崇拝」編、完全収録!!

河南省公安局から「同省出身の暴力団組織が金融機関襲撃を目論んでいる」という情報を得た公安9課は、事件を未然に防ぐため、組織のアジトに乗り込む。なんなく現場を制圧して犯人を逮捕したかに思えたが、組織の金融機関襲撃はフェイクで、真の狙いは別にあった。なんと公安9課が踊らされている隙に、新浜空港に1人の可憐な殺し屋が到着していたのだった。暴力団組織と殺し屋が狙う標的とは、一体!?

16年前にテロリスト「興国の旅団」に誘拐された少女・戸玖良（とくら）エカが、当時の姿のままで現れた。その謎を追って海上保安庁の特殊部隊のメンバーは、「旅団」が占拠している沖縄沖の人工島に潜り込む。しかしその特殊部隊のメンバーは突然、消息を絶ってしまう。一体、人工島で何が起こっているのか!?　また年をとらない少女の謎とは!?　「NOT EQUALテロリスト」編、完全収録!!