風林野球部の新監督は、まさかの佐藤寿也！ 不在だった大吾たち風林ナインの新監督に、あの、佐藤寿也が就任！ さっそく始まる「寿也マジック」・・・ 大吾たちの練習相手に茂野吾郎を呼び、 技能テストでは思わぬ選手に投手の才能を見出す！ 春の大会へ向け本格始動した新体制のチーム。 一体どうなる！？

風林中と“あの強豪”が、合同チームに！？ 野球部を嫌う江頭が、練習場を潰す計画を進めていることが判明！ 宿敵の用意周到な罠を前に、絶望に打ちひしがれる寿也監督…… しかし吾郎が、打開策として“ある中学校”との合併案を思い付く――！！

茂野大吾と眉村道塁が、チームメイトに！！ 風林中と、眉村道塁を擁する強豪・大尾中の“合同ナイン”が結成!!! 唐突なライバルの加入に、睦子の心は激しく揺さぶられる――… 部内の雰囲気が大きく変わる中、さらには冬合宿の実施も決定し!? 茂野ジュニアと眉村ジュニアが、まさかの同じチームに！ 一体どんな科学反応が起きるのか――！？ 新メンバーが２人加入し、“女子９人”となった風林野球部！ 冬合宿、そして春大会に向けて突き進む！！

風林×大尾ナイン、初試合の相手は海堂中！ 大吾率いる風林中と、道塁を擁する大尾中の“合同ナイン”結成。 迎えた冬合宿の初日、練習試合の相手校として姿を現したのは、 吾郎を苦しめた伝説の強豪校、あの「海堂」だった――!!!

約１年ぶりの最新巻！宿敵・海堂戦、決着！ 風林中×大尾中“合同ナイン”VS強豪・海堂、ついに決着！ 冬合宿を終え、春に向けてさらなる成長を目指す大吾たちだが、 佐藤寿也監督にまつわる予想だにしない問題がチームを襲う…！?

風林×大尾合同チーム、解散の危機――！？ メディアに取り上げられ一躍有名になった寿也監督と風林大尾。 その影響で新入生向けの体験入部会は、想像以上の数の希望者が！ だが、部員の増加は風林×大尾合同チームの解散を意味して…！？

風林×大尾の連合ナイン、最後の大会へ！！ 茂野大吾も遂に中学３年生。 風林×大尾の合同チームで、 「負ければ引退」の夏大会へ挑む！ しかし初戦から、かつてのチームメイト・ 卜部＆アンディを擁する清和中学と対戦する可能性が・・・！？