「ミルクタイムにささやいて」から11年後、13歳になった源之助は最近、両親が普通ではない事に気付き始める。毎朝おはようのキスをするほどラブラブな2人に、源之助は目のやり場に困っていた。そして13歳年下の兄弟ができることに！　スケ番の先輩に告白されたり源之助の学園生活はまだまだ問題がいっぱい!?

「ミルクタイムにささやいて」から11年後、13歳になった源之助は、相変わらずラブラブな両親に振り回される毎日。学級委員長の柊を夢で見てから意識するようになってしまった源之助と柊。源之助の事が諦められないスケ番の緋実は、そんな柊に見せつけるような態度をとって困らせて楽しんでいたが、柊の怒りの矛先は源之助に向かい冷たい態度をとられていた…。