突如、宇宙より飛来した「人型の巨人」と「醜い怪獣」。怪獣を打ち倒した巨人は英雄・サマーヒーローとして人類に迎え入れられる。しかし巨大生物の戦闘は大きな傷跡を残していた。戦闘により家族を奪われた少年・大儀マコトは人造怪獣を駆り、英雄への復讐に身を投じる。憎悪を向ける英雄が、幼馴染みである・新野正世と共に在ることを知らずに――。大地を揺るがす空想科学ジュブナイル、衝撃の第1巻!!

決戦場に現れた正世との邂逅は、マコトに拭えぬ疑念を抱かせる。正義の巨人・サマーヒーローと正世の関係性に迷いながらも、運命は否応なくマコトを戦いの渦中へと巻き込んでいく――。2体のデスピリアスを投入した決戦が始まる。連携によりサマーヒーローを追い詰めるもトドメを躊躇うマコトにサマーヒーロー＝正世が放った一撃は――!?　そしてふたりは共有する。それぞれが隠してきた大きな秘密を――。空想科学ジュブナイル、激動の第2巻!!

怪獣を駆り地球へと飛来した宇宙人・イコル族の戦士・カルホーン。そして堂珍チヅルの兄・アキラと共生するショーナリーから語られるふたつの種族の闘争の歴史、そして引き起こされてきた悲劇。真実を知ったマコトと統制官を除くM.A.Dのメンバーはショーナリーの女王を討つべく動き出す――。一方、正世との同化の進みが予想以上なことに焦るサマーヒーローは強硬手段に出る。そして呼応するかのように、全ての生命を利用し種族の復興を目論む傲慢なる女王が表舞台へと現れる――。空想科学ジュブナイル、真実を曝く第3巻!!

表舞台へと現れたショーナリーの女王は意に従わぬ者たちに鉄槌を下すべく、巨大なダイナリーへと変態する！　マコトたちが駆るデスピリアスとサマーヒーローは女王の圧倒的戦闘力に蹂躙され、チヅルとカルホーンは吸収されてしまう！　この危機を打破できるのは、マコトただひとり。サマーヒーローの助言、そして人類の叡智と仲間たちの後押しを受け、マコトは女王の内部へと突入する!!　そして正世との生活の中で変わりつつあったサマーヒーローは残り少ない力を正世に渡すことを決意する――。人類の未来を託された少年少女たちの決戦の行方は―