【電子書籍版『キャプテン』1巻～3巻を収録した合本版】墨谷二中に転校してきた谷口タカオは、野球部の練習に参加しようと、以前いた学校のユニフォームに着替える。それが野球の名門・青葉学院のユニフォームだと気付いた野球部員達は、谷口を凄い大物選手だと思い込んでしまう。しかし青葉学院にいた頃の谷口は、パッとしない二軍の補欠選手で……!?

【電子書籍版『キャプテン』4巻～7巻を収録した合本版】新キャプテンとなった丸井率いる墨谷二中野球部は、前年度優勝校という名誉をひっさげて春の選抜大会に挑んでいく。港南中学との第１戦で、剛腕投手だが守備はまるっきりダメな１年生・近藤をライトに入れた丸井だったが、ライトを馬鹿にする近藤を島田が殴りつけて、チームの雰囲気が悪くなってしまう。そして墨谷を調べ尽くした港南に、大苦戦を強いられる墨谷ナインは……!?

【電子書籍版『キャプテン』8巻～11巻を収録した合本版】夏の地区予選決勝で、急激な成長を遂げたエース・井口がいる江田川中と対決したキャプテン・イガラシ率いる墨谷二中野球部。敬遠で塁に出たイガラシのサインによるチームプレイで１点を先取した墨谷は、イガラシの好投で江田川を０点におさえて最終回を迎える。そして三塁までランナーを進めた墨谷は、井口の変化球をとらえたイガラシの二塁打でさらに１点を奪取するのだが……!?

【電子書籍版『キャプテン』12巻～15巻(完)を収録した合本版】南海中との試合中盤、指の爪を剥がした近藤に代わって、ギリギリの体力ながらも力投を見せるキャプテン・イガラシは、八回まで南海打線をなんとか０点でおさえる。そして先輩・丸井から、指を骨折しても投げ抜いた元キャプテン・谷口の話を聞いた近藤は、闘志を燃やして指の痛みを克服し、限界に達したイガラシと交代してマウンドに立つのだが……!?