「心」を学習中のロボットの少女・いちこ。九の家にやってきて3度目の夏。少しずつ新しい感情が芽生えて…？　中学初めての定期試験で成績が振るわなかった九は、いちこから修理中のロボット・ネオを家庭教師として紹介される。ロボット同士で仲の良さそうな2人に複雑な九は、ある行動に出て――距離ができていた愛とも再び話せるようになった頃いちこの気持ちに大きな変化が…!?

世界で一番好きな人が自分のことを好きになってくれる　たったそれだけでいいのに　夏祭りの帰り道、秘め続けた気持ちを伝えた愛。ラムネ瓶のビー玉のように、ふたりの気持ちが揺れ動く――…時を重ねて成長する九と愛。そして、変わらないいちこ。季節は巡り、3人の関係は複雑に絡み合っていく――…

九といちこ、お互いが恋心を自覚するなか刻一刻と別れは近づいて――…いちこが宇佐美家に来て6年。ついに心のプログラムの完成が見えてきた。別れが目前に迫り、想いを打ち明けようとした九は――。ボーイ・ミーツ・ロボットガール、ついに完結！