南極大陸に飛来した、地球外生命体・トレンチウォーカー。彼らの惑星改造により海面が70ｍ上昇し、東京などの大都市が水没。さらに地球上の水分を神の水・ネクタルへと変換し始め、適応できない者は高確率で死に至っていた…。そんな中、ネクタルに適応可能な一握りの少女達が、潜水艦に乗り、特殊な水着を身にまとい、地球を取り戻すべく戦場へと赴いていた――。等々力ヒロは、戦死した姉からのメッセージを受け、最強の海兵隊員である角刃キリリを捜し、迷いながらもマサカド女子学園潜水艦隊への入隊を志すのだが――!?水着美少女が水鉄砲をぶっ放す！ガールズ・スプラッシュ・アクション開幕！