今度のロックマンは、コンピューターの中のサイバーワールドで戦うネットナビ。 小学5年生の光熱斗とコンビを組んで、悪の組織WWWの刺客に挑む。 特別編「熱斗＆ロック、2人の出会い」収録。

公式ネットバトラーとなった熱斗。同じ公式ライセンスを持つ炎山とともにワイリー率いるWWWに挑むが、その戦いでロックが行方不明に…！ ロックを救うため、「裏インターネット世界」に足を踏み入れた熱斗たち。そこには裏世界に君臨するフォルテがいた!! 描きおろし「鷹岬版ロックマンエグゼ復刊によせて」収録。

裏インターネットで最強のスタイルチェンジ、サイトスタイルを体得したロックたちだったが、あまりにも強大な力をコントロールすることができず、ふとしたきっかけで暴走を始めてしまう。 それを止めたのは炎山＆ブルース、そして謎のネットマフィア・ゴスペル捜査に協力する天才少年ケイ・ユウキだった!! 描きおろしオマケまんが「彩斗くんと熱斗くん」収録。

「おそるべき危機」がついに現実に！ 闇のナビが現実世界に現れ、街を襲撃し始めたのだ！ ウラの王・セレナードから闇と闘う力を授けられた炎山＆ブルースは闇の力の発生源へと向かうが、闇の四天王の猛攻の前に危機に陥る。 熱斗＆ロックは、絆の力で炎山たちを救うことができるのか!? 特別読み切り「フォルテ～最強の証～」、描き下ろしショート「ネットナビ美形トリオと言えば？」収録。

闇の四天王を撃破した熱斗＆炎山の前に、闇の力を得てさらに強くなったフォルテが復活！ 熱斗たちを助けに現れた裏世界の王、セレナードを瞬殺する強力なフォルテに苦戦する2人だったが、絆の力でフォルテに勝利。 だが、その直後「真の闇のナビ・ダークロイド」がフォルテを連れ去っていった…。 フォルテ外伝「フォルテ＆セレナード」収録。

フォルテを連れ去った「真の闇のナビ・ダークロイド」。 ロックに瓜二つのその存在は、強さを求めるロックの思いが闇と融合して生まれた「ロックマンDS(ダークソウル)」だった。 「ロックマンDS」との激闘に勝利をおさめたロックだが、今度は軍事大国アメロッパ軍により指名手配されてしまう!! 特別描き下ろし第1回「ロック&フォルテ二人の旅 前編」収録。

アメロッパ軍に潜伏する反逆者Dr.リーガルは、暗黒の破壊神・ネビュラグレイを使い世界征服を企む。 ついに正体を現したDr.リーガル。闘いの中でロックに迫る「闇の力」!! ロックは闇に堕ちてしまうのか!? 突如現れたフォルテは敵なのか？味方なのか？？ 特別描き下ろし第2回「ロック&フォルテ二人の旅 中編」収録。

禁断の力「獣化(ビーストアウト)」を得たロックは、謎の少女アイリスに導かれて電脳世界の奥深く、アンダーグラウンドへ導かれる。 そこでは封印されていた電脳獣グレイガが目覚めつつあった。 グレイガを倒すために必要な「伝説のプログラム」を手に入れられるのは“最強のナビ”ただ一人…。 外伝「バトルチップスタジアムの悪夢」、超外伝「最終決戦!!ロックvsブルース」、特別描き下ろし最終回「ロック&フォルテ二人の旅 後編」収録。