19世紀初頭――長崎。鎖国下の日本において唯一、西洋との貿易が許された地。異国から様々なモノが入ってくる出島は、時として「人ならぬ怪異」をも招き入れた…！　丸山遊郭の菊花太夫と３人の禿たちが長崎に仇なす人外を討つ！　妖の長崎怪異記！

奉行所、地役人、長崎警護の諸藩、紅毛人に唐人…そして人ならぬ怪異。様々な勢力が入り乱れる長崎には、踏み込んではいけないモノが数多ある。公儀と人外の密約、そして隠れキリシタンの暗躍――この地で起こる事件の裏に怪異あり。丸山遊郭の菊花太夫と３人の禿たち、そして隠密同心の相模は、光と闇のはざまでどう生きていくのか！？

19世紀初頭――突如、長崎沖に現れたイギリスの軍艦・フェートン号。日本を揺るがしたこの史実の裏には、知られざる怪異たちの暗躍があった！　フェートン号の襲来により混乱を極める長崎。この混乱に乗じて市井に潜む吸血鬼たちは反旗を翻す。長崎を足掛かりに吸血鬼の国を築こうとしていたのだ。ヒトと共存していくことを望む菊花太夫、ただ愛する者を守りたいと願う雛あられ、清、こもれび。それぞれの理想が絡み合う中、運命はどんな結末をもたらすのか！？　妖の長崎怪異記、堂々完結！