幼なじみは空飛ぶ巫女!? 亡き母の生まれた島に引っ越した少年・怜音。彼の前に現れた少女・リンコ。彼女は巫女で、不思議な力を持っていた。仲良くなる二人だったが、ある日怜音はリンコから衝撃の告白を受ける。それを聞いた怜音は!?　そしてリンコが背負う運命とは!? ちっちゃな島のおっきな不思議、少年と少女は神の歴史に直面する!?

空飛ぶ巫女の次は喋る土偶!?東京から来たレオは幼なじみのリンコと再会。彼女の不思議な力に驚くも、一緒に過ごす島の暮らしを楽しむ。だが巫女として彼女が背負う島を出たら死ぬという運命にショックを受ける。レオは彼女のために島を出る方法を考えると宣言。そんな時島のお祭りの宵祭で事件が起き、レオはある人と出会う。そして運命が動き始める!!不思議とノスタルジーが満載の第2巻。