19世紀ヴィクトリア朝ロンドン。急拡大する人口にインフラが追いつかず、街路や川は糞尿であふれ、人々は狭い区域に密集して暮らしていた。そんな街を感染症コレラが襲う。当時の常識では感染原因は悪臭（＝瘴気）であったが、その常識に異を唱え、独自の方法論で病の謎に迫った一人の医師がいた。彼の名はジョン・スノウ。

1854年ロンドン、コレラの勢いは未だ衰えることを知らない。 統計家ウィリアム・ファーと知り合ったスノウは、ファーが発表する「死者数のデータ」に、ホワイトヘッドとともに調査した「犠牲者の住所」を重ね合わせて「感染地図」を作成することにに取り組んでいた。 ──そして物語は始まりの地点へ。 1831年キリングワース炭鉱の担当医となったスノウ。そこで彼は、初めてコレラと対峙することになる。