主人公の島村ジョーは鑑別所に収容されていた。 彼は一緒にいた仲間たちと脱走を試みるが、その途中で黒いスーツを着た怪しい集団（黒い幽霊団／ブラック・ゴースト）に捕まってしまう。 意識を失った彼は、気が付くと手術台の上に拘束されていた。 そして傍らには不気味なマスクをしたスカールと名乗る人物が立っていた。 スカールは告げる。「次に目覚めたときはサイボーグだ」と……。 ジョーの身に一体何が――。 9人のサイボーグ戦士がそれぞれ持つ最強スキルを駆使して悪に挑み、無双する！ 石ノ森章太郎の名作「サイボーグ009」、待望の初フルカラー縦読みコミック化！