切り捨て御免、禁じ手無しの極限武闘活劇（アルティメット・クロニクル）!!　最強は誰だ!?　――江戸中期。力のほかに信じるものなく、戦に狂うほか生きる術を知らぬ業深き武芸者どもが集う藩（くに）があった。その名を“鬼の巣”、海原（うなばら）藩――。「最強は誰か」を競う海原大仕合で、命知らずの者どもの戦いが始まる!!

武芸者たちが集う“鬼の巣”海原（うなばら）藩。天下無双を決めるため、三十一の流派が競う“海原大仕合”が始まった!!　まずは、四流派での潰し合い。一人で参加した大亀（おおがめ）流・黒鉄我間（くろがね・ガマ）の次なる相手は『狂弓』中泉（なかいずみ）流!!　初戦で深手を負った我間は、弓を相手に剣でいかに立ち合うのか!?

命を落とすことも厭わず、心・技・体、己の全てを賭して“武”の鬼達が挑む“海原（うなばら）大仕合”。第1回戦で2勝したものの、たった一人で死闘を演じ続ける黒鉄我間（くろがね・ガマ）は、その傷が癒えぬうちに内臓破壊の体術を操る鏡千（きょうせん）流と激突！　鏡千・大丸（だいまる）兄弟の手段を選ばぬ猛攻に、我間は!?

武芸者達が集う“鬼の巣”海原（うなばら）藩で三十一流派が天下無双を競う“海原大仕合”。長刀の天幻（てんげん）流、弓の中泉（なかいずみ）流、体術の鏡千（きょうせん）流と、三流派との激闘をただ一人で勝ち上がってきた我間（ガマ）。しかし続く二回戦、今の実力で近いうちに訪れるは“死”!?　必中必殺、雷電型（イカヅチノカタ）三式を修めよ！

日本刀vs.鎖鎌vs.忍術――最強武術決定戦!!!　三つ巴のバトル開始!!　――最強を競う“海原（うなばら）大仕合”は2回戦、藩主候補の首を懸けた戦いとなった。勝ち上がった十流派は全て猛者ぞろい。大亀（おおがめ）流は、鎖鎌の使い手“皆殺し”の卍卍（かさねまんじ）流に急襲される！　さらには忍術を操る魂隠（たまがくし）流からの攻撃で、直善（なおよし）を護りながらの戦いは、三つ巴の死闘となる……！

卍卍（かさねまんじ）流、魂隠（たまがくし）流の急襲を乗り切るも、未だ3回戦進出を果たせずにいる大亀（おおがめ）流。伊藤乱丸（いとう・らんまる）が引き合わせた次なる敵は、槍使い“四神槍”を擁する明神（みょうじん）流！　我間（ガマ）の父、陣介（じんすけ）との因縁を持つという。さらに主君は唯一、直善（なおよし）が心を許す弟、直勝（なおかつ）だった！　各々が譲れぬ因縁の勝負開始!!

海原（うなばら）大仕合二回戦。相手は“槍”の明神（みょうじん）流。一対一（サシ）の対決、初戦は我間（ガマ）対、重量級の槍を扱う“鬼断（オニダチ）”御堂（みどう）。続いて我間の兄弟子、善丸（ぜんまる）対、“紅抜（ベニヌキ）”榊原（さかきばら）。変形穂先の槍を自在に操る榊原に善丸は苦戦を強いられる。だが善丸には負けられない理由があった……！

“千人斬り”黒鉄陣介（くろがね・じんすけ）、登場!!　ついに我間（ガマ）vs.乱丸（らんまる）が開戦！　勝つのは血を受け継ぎし者か、それとも技を受け継ぎし者か!?　――明神（みょうじん）流の敗北宣言を受け、海原（うなばら）大仕合2回戦勝利と思われた矢先、無宝（むほう）流が直善（なおよし）を連れ去ろうと大亀（おおがめ）流を包囲した！　無宝流の仲間になるか、さもなくば死……!?　そして海原大仕合にも異変が……！

突然の海原（うなばら）大仕合終結。仕合そのものが我間（ガマ）の父・陣介（じんすけ）の野望、国を盗るための布石だった……。その野望のため、直善（なおよし）を連れ去ろうとする「無宝（むほう）流」に完膚なきまで打ちのめされた我間。直善を取り戻すため、今以上に強くなることを決意する！　“究極の強さ”を求め、大亀（おおがめ）流聖地「戎簾（じゅうれん）の里」で修行開始！

大亀（おおがめ）流当主の座をめぐり、真ノ丞（しんのじょう）と伊織（いおり）が激突！　しかし戦いは結果を見ぬまま水入りに。伊織は我間（ガマ）に、“師としての最後の言葉”を残して流派を離脱する。それぞれ違う道を歩み始めた大亀流の面々。全ては直善（なおよし）の奪還と、打倒・陣介（じんすけ）のために。「戎簾（じゅうれん）の里」での我間と善丸（ぜんまる）の修行も、新たな指南役・可士太郎（かしたろう）の下で本格的に再開！