2010年、地球に“SH3・アールヴィル彗星”が接近した。時は流れ2038年、夏。宇宙大好き小学生、沢渡（さわたり）ゆうまは、謎にみちたモノと出会う。人工知能を搭載した家庭用オートボット・ナナコの体を乗っ取るように出現したそいつは、2010年に地球に降下したとき大気圏突入時のトラブルで故障し、団地に擬態して休眠していた人工知能なのだという。「私が宇宙に帰るのを手伝ってもらえないだろうか？」団地経由の宇宙行き、大スケールの極秘ミッションが始まった！

見上げた宇宙（そら）は、未来との約束。2010年、少年少女は地球に落下した“彼”と出会った。そして2038年の今、少年少女の子供たちが偶然から“彼”を見つけ、親と子が力を合わせてその瞬間を待っている。“彼”が再び宇宙へと飛び立つ、その瞬間を――！　太陽系に収まらない極秘ミッション、ついに完結!!