秘密組織のスパイとして育ってきたハイジはある日、任務として社長令嬢である調宮マホロの護衛を依頼される。 ところがあまり危機感のないマホロは、ハイジの監視を逃れて夜の街に飛び出してしまう。 そんなマホロを追いかけたハイジが見たものは『魔法少女シフォン』として謎のモンスターと戦うマホロの姿だった…！ スパイと魔法少女、別々の世界で活躍しているはずの二人が出会う時、何かが動き始めるーー！？