惑星間戦争の勃発から300年。環境汚染が進み、いまや人類の平均寿命は20歳という母なる惑星ブルーにおいて、ただひとり完全な健康体を持つ少年・星光。 彼は、絶滅の危機に瀕する惑星ブルーを救うため、軍に伝わる「チャンネル5計画」を実行することに。 しかしそれには、5つの惑星に散らばる五兄弟の人造戦士、“炎雷剛刃紅の衆”の全員が揃わなければならないという。 そこでブルーの防人(まもりびと)として眠らされていた三男・紅を覚醒させ、彼に主と認められた光は、残りの戦士たちと会うべく、母星ブルーを旅立つが...

惑星ブルーと人類の未来を託され、紅、エドガーと共に第2惑星グレイを訪れた光は、“炎雷剛刃紅の衆”の五男・拳士の剛に出会う。「チャンネル5」計画を実行するため、紅と同じく光を主と認めてくれるよう剛に迫るエドガーだったが、防人(まもりびと)として長年グレイを見守ってきた剛は、グレイの民を見捨てることができない。 そんな中、ブラック軍の進攻を受けたグレイは、星（ガイア）の遺伝子を持つ光と共鳴すると、突如地殻変動を開始してしまうのだった…！ 惑星存亡の危機に陥ったグレイを光は救うことができるのか!? ...

第3惑星グリーンを訪れ、四男である雷と出会った光たち。ところがグリーンの少年に仕える雷は、光を主とすることを頑なに拒否する。 そんな雷に考える時間を与える紅だったが、同じ頃、惑星ブラックの使者としてやってきた次男・刃と将軍の甥・音也が、グリーンの地に降り立っていた。 かくして“炎雷剛刃紅の衆”のうち、4人の兄弟がグリーンに揃う。 しかし、暗黒物質（ダークマター）を投与された刃が、紅に襲いかかり、その再会は思わぬ死闘を呼ぶことに…。 明らかになるエドガーの正体、オージンの悲しき秘密---。真...