西暦2062年、銀河の各地で発生した原因不明の現象「ヴァール症候群」。人類が移住した惑星ピプレでも、寒冷地に棲む大型生物が発症によって凶暴化。この惑星の警備を担当する星間複合企業体ケイオスは、歌による鎮静化実験を立案した。ケイオスの新米パイロットでありアイドルオタクの金城カイトは、売出し中のアイドルグループのメンバー・ピリカ（カイトの推しメン！）と共に人類の存亡を懸けた危険な任務に身を投じてゆく！

原生巨大生物“鰻蟲（ウナムシ）”が凶暴化する「ヴァール症候群」は、ピリカの失踪した父であり、カイトのヲタ友でもある、イワン・ツァーリが計画的に誘発したものだった!!　さらなる大規模な“ヴァール”を起こすため、イワンはとんでもない謀略を実行に移す…!!　最後の敵は“超時空要塞マクロス”!?　人類の生き残りを賭け、カイトとピリカが空前絶後のラストステージに挑む……!!