“外来獣”と名付けられた怪獣が街を荒らしまわる世界。転校してきた女子高生のナユナは、ある日の放課後、地底怪獣に遭遇してしまう。ガタガタと震えるナユナ。だけど次の瞬間、怪獣は倒れてそのお腹の中から、ちっちゃくて細い女の子が現れた。その名はサラ、UBH所属のハンター。サラとの運命の出会いから数日後、ナユナは“怪獣撃退部”に入部する決心をして――。

“外来獣”突如として現れ、人々に脅威を与える存在。その危機から人々を守るため、ナユナたち“怪獣撃退部”は今日も活動中。小型の外来獣“ウオダゴン”に懐かれてしまったナユナは、部室で面倒をみることになった。そんな折、街に出現した巨大植物怪獣バルガドンの侵攻に平穏な日常は崩れ去った。外来獣によるかつてない危機に、ナユナとサラは立ち向かっていく――。JK(女子高生)×KJ(怪獣)の異色の地球防衛譚、ここに完結。