本能寺の変が起きた１年後、京都の遊郭を訪れた侍、半坐。半坐はそこで美しい女、鱗と出会う。実は鱗は甲賀の忍で追っ手から逃れるため、身を隠していた。しかし、鱗を狙う甲賀の忍が現れ、殺そうとする。鱗を助けるために共に戦う半坐も伊賀の忍であった。追っ手を退けた半坐は、鱗と行動を共にすることになるが…。天下を治める首級を求め、忍の者たちの血生臭い命掛けの戦いが始まる！　騙し騙されの異能“忍”活劇開幕!!

鱗は半坐に裏切られ伊賀に捕らわれてしまう。捕らわれた鱗を待ち受けていたのは「数珠髭の間」という拷問部屋だった！　伊賀の忍も本格的に「信長の首」の争奪戦に参加することになる！　忍同士の無情な戦いは混迷を極める!!

鱗は無法の指示で伊賀の忍を討つことを決意する。一方、甲賀の頭領、灯は伊賀忍十座の前に立ち塞がる。伊賀の精鋭を前に、灯は驚愕の忍術を繰り出す!!　信長の首級の争奪戦は伊賀と甲賀の全面戦争へ!!　乱戦！激戦の第３巻!!

鱗と半坐は袂を分かち、鱗は伊賀の忍を討つことを誓う。そしてまた半坐も甲賀の忍と対峙する！　半坐の戦いぶりを見た、甲賀の頭領・灯は幻覚で半坐を魅了してしまう…。混戦！　乱戦!!　伊賀と甲賀の戦争は天下を治める代理戦争へ!!

甲賀の灯の術に嵌った半坐を取り戻すべく、立ちはだかる鱗。一方、激しい戦いをしていた半蔵と無法の戦いに決着がつく…。そして、信長の首を求めて伊賀の里に秀吉の軍勢が押し寄せてきた!!　信長の首は誰が手中に収めるのか!?　最終第５巻!!