死んだ人間が悪しき力で幽鬼となり、人を襲う明慈(めいじ)の世。16歳の女剣士・立花かぐやは幼い頃に交わした約束を頼りに、徳川一威の身を護る「番士」となるため名門・黎明学院に入学する。 波乱の世に咲く宿命の恋。和風幻想學園奇譚、華麗に開幕!

ともに平和な世をつくる。そう誓い合い、徳川一威の「番士」となった若き女剣士・立花かぐや。あるとき二人が通う黎明館学院で学生主催の晩餐会が開かれることになった。護衛役として準備に奔走するかぐやだが、一威に婚約者がいることを知り…?

立花かぐやとその主・徳川一威が通う黎明館学院で、華々しく開かれた晩餐会。不穏な企みを匂わせる織羽を円舞曲のパートナーとして見張るかぐやは…? 一方永久姫は、幽鬼兵を生み出そうとしている機械技師・ジェラルドを止めるため一威にある申し出をして…!?

幽鬼を祓う力を持つ、徳川一威の番士・樋口尚忠。彼と一威との出会いとは…? 一方、晩餐会での事件が解決し、日常を取り戻した黎明館学院だが、大怪我をし剣を振るえなくなったかぐやにさらなる試練が訪れ…!?

黎明館学院「特科」に在籍する生徒が自身の研究成果を提出する自主学習発表会で、互いの学籍をかけて競うことになった一威と織羽。その準備で一威の手伝いをしていた最中、かぐやは織羽に無理やりキスをされてしまう。その時、かぐやの意識に現れたのは……?

夢の姫君・お市と向き合うことになったかぐや。一威は自主学習発表会の場で織羽との対決に臨み…!? かぐやと一威、主従の迎える結末とは…!?　絢爛たる學園剣法絵巻、堂々完結!!