偶然見つけた2次元コードは、とあるアプリをダウンロードさせた。 アプリの名は「ダンジョンシーカーズ」。起動するとモンスターが跋扈するダンジョンへと転移できる摩訶不思議な代物だった。　 毎日が退屈で、生きている心地が希薄な少年、倉瀬広龍はダンジョンシーカーズに出合い、楽しみ、のめり込む──。

突如、広龍の前に現れた""謎の少女""――雨宮里葉。 二人の出会いが、物語の歯車を大きく動かす！ やがて明かされる、《ダンジョンシーカーズ》の""真の正体""。 「このアプリは、ただのゲームじゃない――」 世界を救うため、二人は命を賭けてダンジョン攻略に挑む！ 未知なる上位ダンジョンで、彼らを待ち受けるのは――！？