奉天の街を襲った恐るべき怪鳥“鳧渓（ふけい）”！　なんとか城内を荒らしまくるヤツラを撃退した虎丹（フータン）遊撃隊の龍兵（りゅうへい）たちだったが、その数は2匹のみ。多数いた鳧渓たちは、いずこへか飛び去って行った。かろうじて奉天城内で生き残った民衆は、中国東北軍の助けを待っていた。しかし、彼らの願いは空しく、奉天の空を覆うのは大量の鳧渓たちだった――――。龍兵たちは、未曾有の危機に晒され……!?

群れを成した恐るべき怪鳥“鳧渓（ふけい）”の襲撃に壊滅状態の奉天の街！　しかし、唯一、鳧渓たちが襲って来ないビルがあった――――。生き残った住民たちを引き連れて、そのビルに逃げ込んだ虎丹（フータン）遊撃隊は、ビルが出している電波が鳧渓の弱点なのではないかと考える。そして、独自のバリアを作り、鳧渓たちに挑む龍兵（りゅうへい）たち。しかし、龍兵の体が、今の事態は何かが「違う」と訴えていて……!?

奉天の民衆たちを無事に避難させる為に、鳧渓（ふけい）に立ち向かう龍兵（りゅうへい）たち虎丹（フータン）遊撃隊。死闘の末、地下への針路を開き、人々は退却を始める。しかし、彼等を襲ったのは、日本軍の鳧渓への砲撃だった！　爆撃の影響で電波塔を壊されてしまった龍兵たちは、再び鳧渓たちのターゲットに!!　鳧渓の狙いは玉琴（ユーチン）!?　彼女を攫（さら）われ、怒りに燃える龍兵の体に、またしても変化が……!?

鳧渓（ふけい）に玉琴（ユーチン）を攫われ、怒りを爆発させた龍兵（りゅうへい）に再び変化が現れた……!!　しかし、神憑きの少女・枝華（ジーホワ）は、「龍兵は“青龍”ではなく、青龍のできそこないの“無支祁（むしき）”だ」と民衆に告げる。その結果、圧倒的なパワーで大量の鳧渓を叩き潰して街を救った龍兵だったが、彼が青龍ではないという噂が民衆に広まり、次第に彼に対する不信感が街を覆い始めて行く……!?

自分の中に眠る凶暴な力の正体は“無支祁（むしき）”!?　己の存在に悩みはじめた龍兵は、仲間たちから距離を置こうとし始める。しかし、お前の使命は玉琴（ユーチン）を救出する事だ、との二当家（アルタンジャ）の言葉に、仲間たちと共に、鳧渓（ふけい）の巣・琵琶頂子（ピーパーデインズ）を目指す！　その頃、神憑きの少女・枝華（ジーホワ）は、龍兵と同じ刺青を持つ恵慶（ホイチン）こそが青龍だと告げていた……!!

玉琴（ユーチン）救出の為、琵琶頂子（ピーパーデインズ）のふもとに辿り着いた虎丹（フータン）遊撃隊。山岳隊と龍兵（りゅうへい）たち衛侍隊（ウエイストイ）は、そびえ立つ大岩壁を登り始めた。すかさず襲いくる鳧渓（ふけい）の群れ！　激しい戦いの中、頂上まで登り終えた彼らは、暗闇にまぎれて部隊全員を山頂に集結させる。ついに総攻撃の開始だ!!　そして龍兵たちの向かう洞窟の奥では、最大の敵が待ち構えていた!!

蚩尤（しゆう）に玉琴（ユーチン）を奪われた龍兵たちは、洞窟に閉じ込められた！　本隊と合流し玉琴を救い出すため、決死の脱出を図る彼ら。しかし、頼みの綱である龍兵の破山剣が遂に折れてしまい……。その時、鳧渓（ふけい）のリーダーから語られ始めた“メッセージ”とは!?　謎が明かされる時、古代神の末裔が目論む人類滅亡のプログラムが新たに動き始める――――。壮大な謎を秘めた伝記ファンタジー『青龍』、第一部完！