敷島みどり、18歳。花の大学1年生。彼女が通うのは「東京魔術大学」。“能力者”のみが入学を許された学校。彼女は隠している。何もかも隠している。身分も思想も。孤独も殺意も。

兄を探す。そして、兄を連れ去った奴らは皆殺しにする──。物騒な思惑を胸に秘め、東京魔術大学へと潜入したみどりは「キマイラ計画」の存在を知る。しかし、大学の闇に迫る彼女の前に現れたのは、ちんちくりんなドラゴンだった……。騙されるのがクセになるマジカル・ロジカル・ファンタジー超展開！