近未来のウィーン、ミリオポリス。人々はあらゆる神を信じ、争い、命を落とす……。神学生の冬真は、全宗教合同儀式の式場に向かう途中、テロに襲撃されるが、教会で出会った美しい少女・鳳（アゲハ）に救われる。彼女は公安機動隊ＭＳＳの切り札・自らの身体を武器にしてテロリストと戦う「特甲児童」だった！　機械化された身体を持つ最強の〔炎の妖精〕の少女たちが、混沌の時代の中を生きる！！