特殊工作員の怜司は、潜入先の敵アジトで一人の少女ニーナを救出する。少女は「ドール」と呼ばれる暗殺者だった。身寄りのない少女を保護し監視下に置くため、怜司は一緒に住むことを決意するのだが…。子育てなど無縁だった怜司が、いきなりパパに!?　標的となった男と可愛すぎる暗殺者によるハードボイルド育児コメディー!!

潜入先の敵アジトで少女ニーナを救出したことから一緒に暮らすことになってしまった特殊工作員の怜司。機密通信員の美緒も加わり身辺は一気に賑やかに。そんな中、怜司と美緒の二人は来日したVIPの護衛を担当することになる。一方、浜辺で遊んでいたニーナは暗殺者として送り込まれたドールの少女と遭遇してしまい…。標的となった男と可愛すぎる暗殺者によるハードボイルド育児コメディー第２巻!!

Ｎ機関のサーバーがハッキングされたことを受け美緒に調査任務が命じられる。仮想サーバーに犯人を誘い込み居場所を特定するまでは順調だった。しかし、怜司が犯人を捕獲した次の瞬間、新たなトラップが発動してしまうのだった！怜司とニーナの親子に安息の日々はやってくるのか。標的となった男と可愛すぎる暗殺者によるハードボイルド育児コメディー完結巻!!